Danışma Kurulunun görüşü doğrultusunda, tasarıda yeni madde ihdası yapıldı. Buna göre, İstanbul`da Beykoz Üniversitesi, İzmir`de ise İzmir Bakırçay ve İzmir Demokrasi üniversiteleri kuruldu.
Ayrıca Niğde Üniversitesi`nin adı Ömer Halisdemir Üniversitesi, Celal Bayar Üniversitesi`nin adı Manisa Celal Bayar Üniversitesi, Tunceli Üniversitesi`nin adı Munzur Üniversitesi, Yeni Yüzyıl Üniversitesi`nin adı İstanbul Yeni Yüzyıl Üniversitesi, Yıldırım Beyazıt Üniversitesi`nin adı ise Ankara Yıldırım Beyazıt Üniversitesi olarak değiştirildi.